Opština Gnjilane nalazi se u jugoistočnom delu Kosova, na području Anamorave. To je jedna od najvećih opština u zemlji. Geografski položaj koji je ima, omogućio je dobro povezivanje sa drugim centrima Kosova i regiona.
Ima tri male rijeke, Miruša, Banja i Stanišori, koji se prelaze u Moravu, zapadno od sela Uglar.
Gnjilane je daleko od Prištine, glavnog grada Kosova, 46 kilometara, od Kamenice – 27 km, od Vitine – 22 km, od Novo Brde – oko 25 kilometara. Sa opštine regiona ograničuje se, na jugoistoku sa Preševom (33 km), Kumanovom (53), dok je na istoku – sa Bujanovac (40 km).
Izgradnja puta Gnjilane-Lipljan, iz pravca Kišnojpoli, znatno skraćen rastojanja od prištinskog aerodroma, autoputa i zeleznice. Gnjilane će se uskoro pridružiti Kumanovu, od Stančića, gdje je predviđeno otvaranje jedna prelazna tacka.
Gnjilane ima dobre uslove za poljoprivredu i poznat je kao agroindustrijski grad. Ima kontinentalnu klimu, sa vrućim ljetima i hladnim zimama. Prosječna temperatura u januaru je – 0.9 stepeni celzijusa, dok je prosječna julska temperatura – 21.5 stepeni. Na jesen, kiša pada ovde u proseku je 177 mm, a leto – 129 mm. Količina kiše u proleće je 145 mm, a zimi – 130 mm.
Koordinate grada Gnjilana usklađivanje su stepeni severno 42 i 21:20 stepeni istočno i na visini od 501 i 590 metara, dok je oblast od 475 m u Budrike, do 1000 m nadmorske visine, na granici sa Makedonijom (Stancic).
Gnjilanu zaleđe je bogata mineralima (gvožđe leucid) i mineralnih sirovina (Nasale, Pidic, Kmetoc, Uglare, Perlepnice).
U seizmičkim mapama, Gnjilane je poznato kao region koji označava ranjivost opasnosti.